En el PCIS el Análisis integral de los territorios se configura como un servicio ofrecido por la unidad del Observatorio de Innovación Social cuyo fin será el de aportar insumos suficientes que permitan contar con un diagnóstico integral del territorio que será la base de la toma de decisiones por parte de los actores sobre una región.​

Por medio del trabajo mancomunado con las comunidades, el diálogo de saberes, la evaluación integral del territorio y la confluencia de la mayor cantidad de actores enmarcados en fases y mediante el uso de metodologías y herramientas definidas.​​

Contribuir al desarrollo de los territorios, al ordenamiento de la información y a la vinculación geoespacial de los datos para la toma de decisiones y la gestión de los innovadores sociales. ​

Mediante la IT se pueden evidenciar dinámicas sociales, políticas, económicas y ambientales, realizar diagnósticos participativos, plantear estrategias conjuntas e identificar necesidades, oportunidades y recursos en el territorio.​

Dentro de las principales motivaciones del PCIS se encuentra el de la transformación de los territorios y las comunidades mediante la innovación social como principal herramienta, el Análisis integral de los territorios hace parte de una amplia gama de maneras que se tienen para trabajar con y para las comunidades en busca de la mejora de sus condiciones de vida